中文网站
Asante kwa kutembelea Nature.com. Unatumia toleo la kivinjari na msaada mdogo wa CSS. Kwa uzoefu bora, tunapendekeza utumie kivinjari kilichosasishwa (au uzima hali ya utangamano katika Internet Explorer). Kwa kuongezea, ili kuhakikisha msaada unaoendelea, tunaonyesha tovuti bila mitindo na JavaScript.
Inaonyesha carousel ya slaidi tatu mara moja. Tumia vifungo vya zamani na vinavyofuata kusonga kupitia slaidi tatu kwa wakati mmoja, au tumia vifungo vya slider mwishoni ili kusonga kupitia slaidi tatu kwa wakati mmoja.
Tangu milipuko ya ugonjwa wa coronavirus ya 2019 (COVID-19), vipimo vingi vya ukuzaji wa asidi ya kibiashara (NAATs) vimetengenezwa kote ulimwenguni na vimekuwa vya kawaida. Ingawa vipimo kadhaa viliandaliwa haraka na kutumika kwa vipimo vya utambuzi wa maabara, utendaji wa vipimo hivi haujatathminiwa katika mipangilio mbali mbali. Kwa hivyo, utafiti huu ulilenga kutathmini utendaji wa Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI, na Sansure Biotech Assays kwa kutumia kiwango cha kumbukumbu ya Composite (CRS). Utafiti huo ulifanywa katika Taasisi ya Afya ya Umma ya Ethiopia (EPHI) kutoka 1 hadi 30 Desemba 2020. 164 Sampuli za Nasopharyngeal zilitolewa kwa kutumia Kitengo cha QIAAMP RNA Mini na Mfumo wa Utayarishaji wa Sampuli ya Abbott DNA. Kati ya vielelezo 164, 59.1% walikuwa chanya na 40.9% walikuwa hasi kwa CRS. Uwezo wa biotech ya Sansure ulikuwa chini sana ikilinganishwa na CRS (p <0.05). Uwezo wa biotech ya Sansure ulikuwa chini sana ikilinganishwa na CRS (p <0.05). Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p <0,05). Matokeo mazuri ya Sansure Biotech yalikuwa chini sana ikilinganishwa na CRS (p <0.05).与 CRS 相比 相比 ， Sansure Biotech 的阳性率显着较低 （P <0.05）。与 CRS 相比 相比 ， Sansure Biotech 的阳性率显着较低 （P <0.05）。 У Sansure Biotech ыыло значительно менше положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). Sansure Biotech ilikuwa na matokeo mazuri machache ikilinganishwa na CRS (p <0.05).Makubaliano ya jumla ya uchambuzi huo nne yalikuwa 96.3-100% ikilinganishwa na CRS. Mbali na kiwango cha chini cha positivity ya Assay ya Sansure Biotech, utendaji wa maonyesho hayo manne ulikuwa karibu kulinganishwa. Kama hivyo, Assay ya Sansure [Utafiti tu (RUO)] inahitaji uthibitisho zaidi kwa matumizi yake nchini Ethiopia. Mwishowe, utafiti wa ziada unapaswa kuzingatiwa ili kutathmini uainishaji na madai ya mtengenezaji sahihi.
Upimaji wa maabara ni sehemu ya Mpango Mkakati wa Afya Ulimwenguni (WHO) wa ugonjwa wa ugonjwa wa coronavirus 2019 (COVID-19) Utayari na majibu (SPRP). Ambaye anashauri kwamba nchi zinahitaji kujenga uwezo wa maabara kuboresha utayari, usimamizi sahihi wa kesi, umakini na majibu ya haraka kwa changamoto za afya ya umma. Hii inaonyesha kuwa jukumu la maabara ni muhimu kuashiria ugonjwa na ugonjwa wa mawakala wanaoibuka wa kuambukiza na kudhibiti kuenea kwao.
Utambuzi wa COVID-19 unahitaji habari ya ugonjwa na matibabu, dalili za kibinafsi/ishara, na data ya radiographic na maabara2. Kwa kuwa milipuko ya Covid-19 iliripotiwa huko Wuhan, Uchina, vipimo vingi vya ukuzaji wa asidi ya kibiashara (NAATs) vimetengenezwa kote ulimwenguni. Real-reverse transcript polymerase mnyororo mmenyuko (RRT-PCR) imetumika kama njia ya kawaida na ya kawaida ya utambuzi wa maabara ya ugonjwa kali wa kupumua 2 (SARS-CoV-2) 3. Ugunduzi wa Masi ya SARS-CoV-2 kawaida ni msingi wa N (nucleocapsid protini gene), E (gene ya proteni ya bahasha), na jeni la RNA-tegemezi la RNA polymerase) katika ORF1A/B (sura ya kusoma 1A/B). gene) mkoa uliotambuliwa kutoka kwa genome ya virusi. Wanachukuliwa kuwa maeneo kuu ya kuhifadhiwa yanayopatikana katika genomes ya virusi kwa utambuzi wa virusi4. Kati ya jeni hizi, jeni za RDRP na E zina unyeti wa juu wa uchambuzi, wakati jeni la N lina unyeti mdogo wa uchambuzi5.
Utendaji wa uboreshaji wa PCR unaweza kutofautiana kulingana na mambo kadhaa kama vile: vichapo vya uchimbaji, viboreshaji/kugundua, njia ya uchimbaji, ubora wa mashine ya PCR na vyombo vingine. Kufikia Aprili 2020, vifaa zaidi ya 48 vya utambuzi kutoka nchi tisa vimepokea idhini ya matumizi ya dharura (EUA) kwa utambuzi wa COVID-196. Huko Ethiopia, zaidi ya majukwaa 14 ya wakati halisi ya PCR hutumiwa kwa kugundua PCR ya SARS-CoV-2 katika taasisi 26 za afya za umma, pamoja na ABI 7500, Abbott M2000, Roche 48000 na Quant-studio7. Kwa kuongezea, vifaa anuwai vya mtihani wa PCR vinapatikana, kama mtihani wa jeni wa DAAN, mtihani wa Abbott SARS-CoV-2, mtihani wa Biotech ya Sansure, na mtihani wa SARS-CoV-2 BGI. Ingawa RRT-PCR ni nyeti sana, wagonjwa wengine walio na COVID-19 wanaripoti matokeo mabaya ya uwongo kutokana na nakala za kutosha za asidi ya virusi (RNA) katika sampuli kutokana na ukusanyaji usiofaa, usafirishaji, uhifadhi na utunzaji, na upimaji wa maabara. Masharti na vitendo vya wafanyikazi8. Kwa kuongezea, sampuli au udhibiti wa kuweka, kizingiti cha mzunguko (CT), na urekebishaji wa msalaba na asidi nyingine za kiini cha pathogenic au haifanyi kazi/mabaki ya SARS-CoV-2 RNA inaweza kusababisha matokeo chanya ya uwongo katika uainishaji wa RRT-PCR9. Kwa hivyo, ni wazi kuwa vipimo vya PCR vinaweza kubaini wabebaji wa vipande vya jeni, kwani hata hawawezi kutofautisha kati ya jeni la virusi linalofanya kazi, kwa hivyo vipimo vinaweza tu kubaini wabebaji na sio wagonjwa10. Kwa hivyo, ni muhimu kutathmini utendaji wa utambuzi kwa kutumia njia za kawaida katika mpangilio wetu. Ingawa reagents nyingi za NAAT zinapatikana katika Taasisi ya Afya ya Umma ya Ethiopia (EPHI) na kote nchini, hakuna tathmini ya kulinganisha ya ufanisi wao bado imeripotiwa. Kwa hivyo, utafiti huu ulilenga kutathmini utendaji wa kulinganisha wa vifaa vinavyopatikana kibiashara kwa kugundua SARS-CoV-2 na RRT-PCR kwa kutumia vielelezo vya kliniki.
Jumla ya washiriki 164 walio na watuhumiwa wa Covid-19 walijumuishwa katika utafiti huu. Sampuli nyingi zilitoka kwa vituo vya matibabu (118/164 = 72%), wakati washiriki 46 (28%) waliobaki walikuwa kutoka vituo visivyo vya matibabu. Kati ya washiriki ambao hawajatibiwa katika kituo hicho, 15 (9.1%) walikuwa na kesi za kliniki na 31 (18.9%) walikuwa na mawasiliano ya kesi zilizothibitishwa. Washiriki wa tisini na tatu (56.7%) walikuwa wa kiume, na umri wa (± SD) wa washiriki ulikuwa miaka 31.10 (± 11.82).
Katika utafiti huu, viwango vyanya na hasi vya vipimo vinne vya COVID-19 viliamuliwa. Kwa hivyo, viwango chanya vya assay ya Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene 2019-NCOV Assay, Assay ya SARS-CoV-2 BGI, na Assure Biotech 2019-NCOV walikuwa 59.1%, 58.5%, 57.9% na 55.5%. Alama nzuri na hasi ya kumbukumbu ya kumbukumbu (CRS) ilikuwa 97 (59.1%) na 67 (40.9%), mtawaliwa (Jedwali 1). Katika utafiti huu, ufafanuzi wa CRS ulitokana na sheria "yoyote chanya", ambayo kati ya matokeo manne ya mtihani, matokeo mawili au zaidi ya mtihani ambayo yalitoa matokeo hayo yalizingatiwa kuwa ya kweli au hasi.
Katika utafiti huu, tulipata makubaliano hasi ya asilimia (NPA) ya 100% (95% CI 94.6-1100) kwa uchambuzi wote ukilinganisha na CRS. Mchanganuo wa bioteknolojia ya Sansure ilionyesha PPA ndogo ya 93.8% (95% CI 87.2-97.1) na uchambuzi wa DAAN 2019-NCOV ulikuwa na makubaliano ya jumla ya 99.4% (95% CI 96.6-99.9). Kwa kulinganisha, makubaliano ya jumla kati ya Assay ya SARS-CoV-2 BGI na Assay ya Sansure Biotech 2019-NCOV ilikuwa 98.8% na 96.3%, mtawaliwa (Jedwali 2).
Cohen's Kappa mgawo wa makubaliano kati ya CRS na matokeo ya assay ya Abbott SARS-CoV-2 yalikuwa thabiti kabisa (k = 1.00). Vivyo hivyo, maadili ya Kappa ya Cohen yaliyogunduliwa na Daan Gene 2019-NCOV, SARS-CoV-2 BGI, na Sansure Biotech 2019-NCOV pia yanaendana kikamilifu na CRS (K ≥ 0.925). Katika uchanganuzi huu wa kulinganisha, mtihani wa mraba-mraba (mtihani wa McNemar) ulionyesha kuwa matokeo ya Assure Biotech 2019-NCOV yalikuwa tofauti sana na matokeo ya CRS (p = 0.031) (Jedwali 2).
Kama inavyoonyeshwa kwenye mtini.1 Asilimia ya thamani ya chini ya CT (<20 CT) ya Abbott SARS-CoV-2 assay (pamoja RDRP na N gene) ilikuwa 87.6% na ORF1A/B Gene CT thamani ya Sansure Biotech 2019-NCoV ilionyesha kuwa asilimia ya thamani ya chini ya CT (<20 CT) ilikuwa 50.3% na kiwango cha juu cha CT. 1 Asilimia ya thamani ya chini ya CT (<20 CT) ya Abbott SARS-CoV-2 assay (pamoja RDRP na N gene) ilikuwa 87.6% na ORF1A/B Gene CT thamani ya Sansure Biotech 2019-NCoV ilionyesha kuwa asilimia ya thamani ya chini ya CT (<20 CT) ilikuwa 50.3% na kiwango cha juu cha CT.Kama inavyoonyeshwa kwenye mtini.1. Orf1a/b анализа Sansure Biotech 2019-ncov показало что процент низкоfо значеения ct (<20 ct) составляло 3,2%. 1, asilimia ya uchambuzi wa chini wa thamani ya CT (<20 CT) ya Abbott SARS-CoV-2 (pamoja gene RDRP na N) ilikuwa 87.6%, na thamani ya CT ya uchambuzi wa jeni wa ORF1A/B wa Sansure Biotech 2019-Ncov ilionyesha kuwa asilimia ya thamani ya chini ya CT (<20 CT) kwa asilimia 50.3 CT kwa asilimia 50. 3.2%.1 1的百分比为 3.2%。 Kama inavyoonyeshwa kwenye Mchoro 1, asilimia ya chini ya thamani ya CT (<20 CT) ya mtihani wa Abbott SARS-CoV-2 (mchanganyiko wa RDRP na N gene) ni 87.6%, orf1a/b gene CT ya thamani ya Sansure Biotech 2019-Ncov inaonyesha chini CT 值 (<20 CT) 的 Asilimia 的 高 高 CT) CT 的 CT) CT 的 CT) CT 的 CT 的 ACCE ACENT IS 50%高 asilimia 的 高 CT) 3.2%. Как показано на рисунке 1, анализ Abbott sars-cov-2 (сочетающий гены rddrp и n) имел самое низкое размере 87,6%, na значение ct гена Orf1a/b в иследовании Biotech 2019- анализ ncov показал низкий ct. Kama inavyoonyeshwa kwenye Mchoro 1, assay ya Abbott SARS-CoV-2 (inayochanganya aina ya RDRP na N) ilikuwa na asilimia ya chini ya thamani ya CT (<20 CT) kwa 87.6%, wakati thamani ya CT ya jeni la ORF1a/B kwenye utafiti wa Sansure Biotech 2019-uchambuzi wa NCOV ulionyesha CT ya chini. Процент значений (<20 ct) составил 50,3%, na процент ысоких значений CT (36-40 ct) составил 3,2%. Asilimia ya maadili (<20 CT) ilikuwa 50.3%, na asilimia ya viwango vya juu vya CT (36-40 CT) ilikuwa 3.2%.Mtihani wa Abbott SARS-CoV-2 B ulirekodi maadili ya CT hapo juu 30. Kwa upande mwingine, kwenye gene ya BGI SARS-CoV-2 Assay ORF1A/B ilikuwa na thamani kubwa ya CT (> 36 CT) ilikuwa 4% (Mtini. 1). Kwa upande mwingine, kwenye gene ya BGI SARS-CoV-2 Assay ORF1A/B ilikuwa na thamani kubwa ya CT (> 36 CT) ilikuwa 4% (Mtini. 1). С другой стороны, анализе BGI SARS-COV-2 ген Orf1a/B имел ыыокое значение ct (> 36 ct), процент к%. Kwa upande mwingine, katika uchambuzi wa BGI SARS-CoV-2 gene ORF1A/B ilikuwa na thamani kubwa ya CT (> 36 CT), asilimia ambayo ilikuwa 4% (Kielelezo 1).另一方面 ， 在 BGI SARS-COV-2 检测中 检测中 ORF1A/B 基因具有高 CT 值> 36 CT） 的百分比为 4%（图 1）。 Kwa upande mwingine, katika ugunduzi wa BGI SARS-CoV-2, asilimia ya jeni la ORF1A/B na bei ya juu ya CT (> 36 CT) ni 4% (Kielelezo 1). С другой стороны, анализе BGI SARS-COV-2 процент генов orf1a/b с с ысокими значения ct (> 36 ct). 4. Kwa upande mwingine, katika uchambuzi wa BGI SARS-CoV-2, asilimia ya jeni la ORF1A/B na viwango vya juu vya CT (> 36 CT) ilikuwa 4% (Mtini. 1).
Katika utafiti huu, tulichukua sampuli 164 za nasopharyngeal. Kwa kila aina ya uozo, kutengwa kwa RNA na ukuzaji kulifanywa kwa kutumia njia na vifaa vilivyopendekezwa na wazalishaji husika.
Utafiti huu ulionyesha kuwa mtihani wa Abbott wa SARS-CoV-2 una utendaji sawa wa kugundua kama CRS, na 100% chanya, hasi, na jumla ya concordance. Makubaliano ya Kappa ya Cohen ni 1.00, yanaonyesha makubaliano kamili na CRS. Utafiti kama huo uliofanywa na Chuo Kikuu cha Washington huko Merika uligundua kuwa unyeti wa jumla na maalum ya mtihani wa Abbott kwa SARS-CoV-2 ilikuwa 93% na 100%, mtawaliwa, ikilinganishwa na assay iliyoamuliwa na maabara (LDA) ya CDC. 11. Mfumo wa kugundua wa Abbott SARS-CoV-2 ni msingi wa ugunduzi wa pamoja wa aina ya N na RDRP, kwani jeni zote mbili ni nyeti zaidi, hupunguza ubaya wa uwongo12. Utafiti huko Vienna, Austria pia ilionyesha kuwa idadi kubwa ya sampuli za uchimbaji na kiwango cha kugundua athari za kupunguzwa na kuongezeka kwa ufanisi wa kugundua13. Kwa hivyo, mechi kamili ya Abbott kwa assay ya SARS-CoV-2 inaweza kuhusishwa na mfumo wa kugundua jukwaa ambao wakati huo huo hugundua jeni za kujumuisha, huondoa idadi kubwa ya sampuli (0.5 ml), na hutumia kiwango kikubwa cha (40 µL).
Matokeo yetu pia yalionyesha kuwa utendaji wa kugundua wa mtihani wa maumbile ya DAAN ulikuwa sawa na ile ya CRS. Hii ni sawa na utafiti14 uliofanywa katika Chuo Kikuu cha Anhui huko Huainan, Uchina, na madai ya mtengenezaji ya makubaliano mazuri ya 100%. Licha ya ripoti za matokeo thabiti, sampuli moja ilikuwa ya uwongo baada ya kurudisha nyuma ile ile, lakini ilikuwa nzuri katika Abbott SARS-CoV-2 na Sansure Biotech NCOV-2019. Hii inaonyesha kuwa kunaweza kuwa na kutofautisha katika matokeo katika aina tofauti za uozo. Walakini, katika utafiti uliofanywa nchini China15, matokeo ya assay ya jeni ya DAAN yalikuwa tofauti sana (p <0.05) ikilinganishwa na kumbukumbu yao ya maabara iliyofafanuliwa. Walakini, katika utafiti uliofanywa nchini China15, matokeo ya assay ya jeni ya DAAN yalikuwa tofauti sana (p <0.05) ikilinganishwa na kumbukumbu yao ya maabara iliyofafanuliwa. Тем не менее, и и и, лораторного эталонного анализа. Walakini, katika utafiti nchini China15, matokeo ya uchambuzi wa DAAN Gene yalikuwa tofauti sana (p <0.05) kutoka kwa uchambuzi wa kumbukumbu ya maabara.然而 ， 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异 （p <0.05）。然而 ， 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差 <0.05 Однако в сравнению с его эталонным лабораторныы тестом. Walakini, katika utafiti nchini China15, matokeo ya mtihani wa maumbile ya DAAN yalikuwa tofauti sana (p <0.05) ikilinganishwa na mtihani wake wa maabara ya kumbukumbu.Utofauti huu unaweza kuwa ni kwa sababu ya usikivu wa mtihani wa kumbukumbu kugundua SARS-CoV-2, na masomo zaidi yanaweza kuwa muhimu kuamua sababu.
Kwa kuongezea, utafiti wetu ulitathmini utendaji wa kulinganisha wa SARS-CoV-2 BGI na CRS, kuonyesha makubaliano bora ya asilimia (PPA = 97.9%), makubaliano hasi ya asilimia (NPA = 100%), na makubaliano ya jumla ya asilimia na jinsia (OPA). ). = 98.8%). Thamani za Kappa za Cohen zilionyesha makubaliano mazuri (k = 0.975). Utafiti katika Uholanzi16 na China15 umeonyesha matokeo thabiti. Mtihani wa SARS-CoV-2 BGI ni mtihani wa kugundua wa jeni moja (ORF1A/B) kwa kutumia amplization 10 µL/kugundua. Licha ya makubaliano mazuri ya takwimu na matokeo yetu ya kumbukumbu, uchambuzi ulikosa sampuli mbili chanya (1.22%) ya sampuli jumla. Hii inaweza kuwa na athari kubwa ya kliniki kwa mienendo ya maambukizi katika viwango vya mgonjwa na jamii.
Mchanganuo mwingine wa kulinganisha uliojumuishwa katika utafiti huu ulikuwa Assure Biotech NCOV-2019 RRT-PCR (RUO); Asilimia ya jumla ya mechi ilikuwa 96.3%. Nguvu ya makubaliano pia iliamuliwa na thamani ya Kappa ya Cohen, ambayo ilikuwa 0.925, ikionyesha makubaliano kamili na CRS. Tena, matokeo yetu ni sawa na tafiti zilizofanywa katika Chuo Kikuu cha Kati Kusini huko Changsha, Uchina, na katika Idara ya Maabara ya Kliniki ya Hospitali ya Watu ya Liuzhou, Jiji la Liuzhou, China17. Hata ingawa concordance nzuri ya takwimu hapo juu ilirekodiwa, mtihani wa mraba-mraba (mtihani wa Macnemar) ulionyesha kuwa matokeo ya assay ya Biotech ya Sansure imekuwa na tofauti kubwa ya takwimu ikilinganishwa na CRS (p <0.005). Hata ingawa concordance nzuri ya takwimu hapo juu ilirekodiwa, mtihani wa mraba-mraba (mtihani wa Macnemar) ulionyesha kuwa matokeo ya assay ya Biotech ya Sansure imekuwa na tofauti kubwa ya takwimu ikilinganishwa na CRS (p <0.005). Несмотря на т, что ыыло зафиксировано указаное ышыше хороше статистическое соответстstani, ( 0,005). Ingawa makubaliano mazuri ya takwimu hapo juu yalirekodiwa, mtihani wa mraba-mraba (mtihani wa McNemar) ulionyesha kuwa matokeo ya assay ya Sansure Biotech yalikuwa na tofauti kubwa ya takwimu ikilinganishwa na CRS (p <0.005).尽管记录了上述良好的统计一致性 ， 但卡方检验 （Macnemar 检验） 表明 表明 Sansure Biotech 检测的结果与 crs 相比具有统计学显着差异 （p <0.005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 但 但 Несмотря на отмеченое ыше хороше статистическое соответствие, статистически значимую разницу (p <0,005) между анализом Sansure Biotech na crs. Licha ya makubaliano mazuri ya takwimu yaliyotajwa hapo juu, mtihani wa mraba-mraba (mtihani wa McNemar) ulionyesha tofauti kubwa ya takwimu (p <0.005) kati ya assay ya biotech ya Sansure na CRS.Sampuli sita (3.66%) zilipatikana kuwa mbaya za uwongo ikilinganishwa na CRS (Jedwali la 1); Hii ni muhimu sana, haswa kutokana na mienendo ya maambukizi ya virusi. Takwimu hapo juu pia inasaidia kiwango hiki cha chini cha kugundua15.
Katika utafiti huu, maadili ya CT yalidhamiriwa kwa kila assay na jukwaa husika, na maana ya chini kabisa ya CT iliyoripotiwa katika assay ya Abbott SARS-CoV-2. Matokeo haya yanaweza kuhusishwa na mfumo wa upimaji wa maumbile wa wakati huo huo wa Abbott kwa kugundua SARS-CoV-2. Kwa hivyo, kulingana na Kielelezo 1, 87.6% ya matokeo ya Abbott SARS-CoV-2 yalikuwa na maadili ya CT chini ya 20. Idadi ndogo tu ya matokeo ya sampuli (12.4%) yalikuwa katika safu ya 20-30. Thamani za CT hapo juu 30 hazikurekodiwa. Mbali na utumiaji wa Abbott wa muundo wa upimaji wa jopo la SARS-CoV-2, matokeo haya yanaweza kuhusishwa na kikomo cha chini cha kugundua (nakala 32.5 RNA/ml) 18, ambayo ni chini ya mara tatu kuliko kikomo cha chini cha kampuni ya nakala 100 za RNA/ml. ML) 19.
Utafiti huu una mapungufu kadhaa: kwanza, hatuna njia za kawaida/kumbukumbu [kama mzigo wa virusi au vipimo vingine vya maabara (LDA)] kwa sababu ya ukosefu wa rasilimali. Pili, vielelezo vyote vilivyotumika katika utafiti huu vilikuwa swabs za nasopharyngeal, wakati matokeo hayakutumika kwa aina zingine za mfano, na tatu, saizi yetu ya mfano ilikuwa ndogo.
Utafiti huu ulilinganisha utendaji wa maonyesho manne ya RRT-PCR ya SARS-CoV-2 kwa kutumia sampuli za nasopharyngeal. Uchunguzi wote wa kugundua ulikuwa na utendaji sawa, isipokuwa kwa assay ya Biotech ya Sansure. Mbali na hilo, kiwango cha chini cha positivity kiligunduliwa katika assay ya Sansure Biotech ikilinganishwa na CRS (p <0.05). Mbali na hilo, kiwango cha chini cha positivity kiligunduliwa katika assay ya Sansure Biotech ikilinganishwa na CRS (p <0.05). Кроме тоpоо, тесте sansure biotech ыыл ыявлен x Kwa kuongezea, mtihani wa Biotech ya Sansure ulionyesha asilimia ndogo ya matokeo mazuri ikilinganishwa na CRS (p <0.05).此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p < 0.05)。此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p < 0.05)。 Кроме тоpоо, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с crs (p <0,05). Kwa kuongezea, assay ya Sansure Biotech ilikuwa na kiwango cha chini cha positivity ikilinganishwa na CRS (p <0.05).Uchambuzi wa Sansure Biotech NCOV-2019 (RUO) ya PPA, NPA na makubaliano ya jumla yalizidi 93.5% na nguvu ya Cohen Kappa ya dhamana ya makubaliano ya 0.925. Mwishowe, Sansure Biotech Assay (RUO) inahitaji uthibitisho zaidi wa matumizi nchini Ethiopia, na utafiti wa ziada unapaswa kuzingatiwa kutathmini madai kutoka kwa wazalishaji binafsi.
Ubunifu wa utafiti wa kulinganisha ulifanywa katika vituo vinne vya afya huko Addis Ababa, Hospitali ya Eka Kotebe, Kituo cha Matibabu cha Kanisa la Milenia, Hospitali ya Ukumbusho ya Zewooditu, na Hospitali ya Kifua kikuu ya Kifua kikuu cha St. Peter. Takwimu hizo zilikusanywa kati ya Desemba 1 na 31, 2020. Vituo vya matibabu vya utafiti huu vilichaguliwa kwa kusudi kulingana na idadi yao kubwa ya kesi na kupatikana kwa vituo vikuu vya matibabu jijini. Vivyo hivyo, vyombo, pamoja na vyombo vya PCR vya ABI 7500 na Abbott M2000, vilichaguliwa kulingana na mapendekezo ya wazalishaji wa NAAT reagent, na vifaa vinne vya kugundua PCR vilichaguliwa kwa utafiti huu, kwani maabara nyingi nchini Ethiopia zilitumia angalau nne kati yao. Mtihani wa Gene, mtihani wa Abbott SARS-CoV-2, mtihani wa biotech ya Sansure, na mtihani wa SARS-CoV-2 BGI uliofanywa wakati wa masomo).
Upimaji wa SARS-CoV-2 ulifanywa kutoka 1 hadi 30 Desemba 2020 kwa kutumia mililita 3 ya kati ya usafirishaji wa virusi (VTM) (Teknolojia ya Miraclean, Shenzhen, Uchina) kutoka kwa watu walio chini ya uchunguzi wa COVID-19 ilirejelewa EPHI. Sampuli za Nasopharyngeal zilikusanywa na watoza sampuli zilizofunzwa na kupelekwa kwa EPHI katika pakiti tatu. Kabla ya kutengwa kwa asidi ya kiini, kila sampuli hupewa nambari ya kitambulisho cha kipekee. Uchimbaji hufanywa kutoka kwa kila sampuli mara tu baada ya kuwasili kwa kutumia njia za mwongozo na moja kwa moja za uchimbaji. Kwa hivyo, kwa uchimbaji wa moja kwa moja wa Abbott M2000, 1.3 ml (pamoja na kiwango cha 0.8 ml iliyokufa na kiwango cha kuingiza cha 0.5 ml) ya sampuli hiyo ilitolewa kutoka kwa kila sampuli na kupitishwa kupitia mfumo wa utayarishaji wa mfano wa Abbott DNA (Abbott Masi Inc. Des Plaines, IL, USA). ) Kundi la sampuli 96 [92, udhibiti wa kugundua mbili na udhibiti mbili zisizo za template (NTC)] ulijumuishwa katika mchakato wa jumla (urejeshaji na kugundua) wa raundi mbili za SARS-CoV-2 (EUA) kwa wakati halisi. madini. Vivyo hivyo, kwa uchimbaji wa mwongozo, tumia sampuli sawa (kwa uchimbaji wa moja kwa moja na ugunduzi). Kwa hivyo, katika mchakato wote, sampuli 140 µL zilibadilishwa na kutolewa kwa kutumia Kitengo cha QIAAMP RNA Mini Kit (Qiagen GmbH, Hilden, Ujerumani) katika vikundi vya 24 (pamoja na sampuli 20, udhibiti wa assay mbili na NTC mbili) zaidi ya raundi tisa. Eluates zilizotolewa kwa mikono ziliongezwa na kugunduliwa kwa kutumia cycler ya mafuta ya ABI 7500 kwa kutumia SARS-CoV-2 BGI assay, Daan Gene Assay, na Assay ya Sansure Biotech.
Kutengwa kwa kiotomatiki na utakaso wa RNA ya SARS-CoV-2 RNA ifuatavyo kanuni ya bead ya sumaku kwa kutumia Abbott DNA sampuli za maandalizi ya sampuli. Uvumbuzi wa sampuli na umumunyishaji wa chembe za virusi hufanywa kwa kutumia sabuni iliyo na guanidine isothiocyanate kuashiria protini na RNase. RNA basi hutengwa na protini na mgawanyo wa awamu thabiti kwa kutumia silika, yaani, chumvi ya guanidinium na pH ya alkali ya buffer ya lysis inakuza kumfunga asidi ya kiini kwa silika (SiO2). Hatua ya kuosha huondoa protini zilizobaki na uchafu ili kutoa suluhisho wazi. RNA ya uwazi imetengwa na microparticles ya msingi wa silika kwa kutumia shamba la umeme la chombo20,21. Kwa upande mwingine, kutengwa kwa mwongozo na utakaso wa RNA hufanywa na njia ya safu ya spin kwa kutumia centrifugation badala ya msimamo wa sumaku na mgawanyo wa microparticles kutoka kwa upole.
Mtihani wa kugundua wa Abbott wa wakati halisi wa SARS-CoV-2 (Abbott Masi, Inc.) ulifanywa kulingana na maagizo ya mtengenezaji, ambayo yalipokea EUA19,22 kutoka kwa WHO na FDA. Katika itifaki hii, uvumbuzi wa sampuli kabla ya uchimbaji ulifanywa katika umwagaji wa maji kwa 56 ° C kwa dakika 30. Baada ya uvumbuzi wa virusi, uchimbaji wa asidi ya kiini ulifanywa kwenye chombo cha Abbott M2000 SP kutoka 0.5 ml VTM kwa kutumia mfumo wa maandalizi wa sampuli ya Abbott M2000. Kulingana na mtengenezaji. Upandishaji na ugunduzi ulifanywa kwa kutumia chombo cha Abbott M2000 RT-PCR, na ugunduzi wa pande mbili ulifanywa kwa aina ya RDRP na N. ROX) na VIC P (rangi ya wamiliki) kwa kulenga na kugundua udhibiti wa ndani, ikiruhusu kugundua wakati huo huo wa bidhaa zote mbili za kukuza 19.
Njia ya kugundua ya kit hii ni msingi wa teknolojia ya hatua moja ya RT-PCR. Aina za ORF1A/B na N zilichaguliwa kama mikoa iliyohifadhiwa na teknolojia ya jeni ya DAAN kugundua ukuzaji wa mkoa wa lengo. Primers maalum na uchunguzi wa fluorescent (n gene probes iliyoandikwa na FAM, orf1a/b probes zilizo na VIC) imeundwa kugundua SARS-CoV-2 RNA katika sampuli. Mchanganyiko wa mwisho na mchanganyiko wa bwana ulitayarishwa kwa kuongeza 5 µL ya wazi hadi 20 µL ya mchanganyiko wa bwana kwa kiasi cha mwisho cha 25 µL. Upandishaji na kugundua zilifanywa wakati huo huo kwenye chombo cha PCR cha wakati halisi.
Jeni la ORF1A/B na N liligunduliwa kwa kutumia Kitengo cha Utambuzi cha Sansure Biotech NCOV-2019 (Ugunduzi wa Fluorescent PCR). Andaa uchunguzi maalum kwa kila jeni la lengo kwa kuchagua kituo cha FAM kwa mkoa wa ORF1A/B na kituo cha ROX kwa jeni la N. Kwa kitengo hiki cha assay, viboreshaji vya mchanganyiko na mchanganyiko huongezwa kama ifuatavyo: jitayarisha 30 µL Master Mchanganyiko wa Reagent na sampuli 20 za µL zilizowekwa kwa kugundua/kukuza. PCR ABI 750025 ya kweli ilitumika kwa kukuza/kugundua.
Mtihani wa SARS-CoV-2 BGI ni kitengo cha wakati halisi cha RRT-PCR kwa utambuzi wa COVID-19. Kanda ya lengo iko katika mkoa wa ORF1A/B wa genome ya SARS-CoV-2, ambayo ni njia moja ya kugundua jeni. Kwa kuongezea, jeni la uhifadhi wa nyumba β-Actin ni jeni la lengo la ndani. Mchanganyiko wa bwana umeandaliwa kwa kuchanganya µL 20 ya mchanganyiko wa mchanganyiko wa bwana na 10 µL ya sampuli ya RNA iliyotolewa kwenye kisima cha sahani26. Chombo cha ABI 7500 fluorescent idadi halisi ya PCR ilitumika kwa kukuza na kugundua. Uboreshaji wote wa asidi ya kiini, hali ya kukimbia ya PCR kwa kila assay, na tafsiri ya matokeo ilifanywa kulingana na maagizo ya mtengenezaji husika (Jedwali 3).
Katika uchambuzi huu wa kulinganisha, hatukutumia njia ya kiwango cha kumbukumbu kuamua makubaliano ya asilimia (chanya, hasi, na jumla) na vigezo vingine vya kulinganisha kwa uchambuzi huo nne. Kila kulinganisha kwa jaribio kulifanywa na CRS, katika utafiti huu CRS iliwekwa na sheria "yoyote chanya" na matokeo yake yalidhamiriwa, sio kwa mtihani mmoja, tulitumia angalau matokeo mawili ya mtihani. Kwa kuongezea, katika kesi ya maambukizi ya Covid-19, matokeo hasi ya uwongo ni hatari zaidi kuliko matokeo chanya ya uwongo. Kwa hivyo, kusema "chanya" kwa usahihi iwezekanavyo kutoka kwa matokeo ya CRS, angalau vipimo viwili vya assay lazima iwe nzuri, ikimaanisha kuwa angalau matokeo mazuri yanaweza kutoka kwa assay ya EUA. Kwa hivyo, kati ya matokeo manne ya mtihani, matokeo mawili au zaidi ya mtihani ambayo hutoa matokeo sawa yanachukuliwa kuwa chanya au hasi18,27.
Takwimu zilikusanywa kwa kutumia fomu za uchimbaji wa data, uingiliaji wa data na uchambuzi ulifanywa kwa kutumia Programu ya Takwimu ya Excel na toleo la SPSS 23.0 kwa takwimu za kuelezea. Makubaliano mazuri, hasi, na ya jumla ya asilimia yalichambuliwa, na alama ya Kappa ilitumiwa kuamua kiwango cha makubaliano ya kila njia na CRS. Thamani za Kappa zinatafsiriwa kama ifuatavyo: 0.01 hadi 0.20 kwa makubaliano ya laini, 0.21 hadi 0.40 kwa makubaliano ya jumla, 0.41-0.60 kwa makubaliano ya wastani, 0.61-0.80 kwa makubaliano makubwa na 0.81-0.99 kwa makubaliano kamili28.
Kibali cha maadili kilipatikana kutoka Chuo Kikuu cha Addis Ababa na itifaki zote za majaribio za utafiti huu zilipitishwa na Bodi ya Taasisi ya Sayansi ya Sayansi ya Ethiopia. Nambari ya kumbukumbu ya leseni ya maadili ya EPHI ni EPHI/IRB-279-2020. Njia zote zilitumika kulingana na mapendekezo na vifungu vya Miongozo ya Kitaifa ya Ethiopia ya matibabu ya COVID-19. Kwa kuongezea, idhini iliyoandikwa iliyoandikwa ilipatikana kutoka kwa washiriki wote wa masomo kabla ya kushiriki katika utafiti.
Takwimu zote zilizopatikana au kuchambuliwa katika utafiti huu zinajumuishwa katika nakala hii iliyochapishwa. Takwimu zinazounga mkono matokeo ya utafiti huu zinapatikana kutoka kwa mwandishi husika juu ya ombi linalofaa.
Shirika la Afya Ulimwenguni. Mapendekezo ya mikakati ya upimaji wa maabara kwa COVID-19: Mwongozo wa Mpito, Machi 21, 2020 No. WHO/2019-NCOV/LAB_TESTING/2020.1 (WHO, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki covid-19 Smart Utambuzi katika Idara ya Dharura: All-in. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki covid-19 Smart Utambuzi katika Idara ya Dharura: All-in.Muliou, DS, Pantazopoulos, mimi na Gurgulianis, DI Akili ya utambuzi wa COVID-19 katika idara ya dharura: kila kitu katika mazoezi.Muliou DS, Pantazopoulos I. na Gurgulyanis Ki Akili ya utambuzi wa COVID-19 katika idara za dharura: Ushirikiano wa mwisho-mwisho katika mazoezi. Mtaalam Reverend Resquire. dawa. 3, 263-272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Tathmini ya kitambulisho cha COVID19 sasa EUA assay. Mitchell, SL & St George, K. Tathmini ya kitambulisho cha COVID19 sasa EUA assay.Mitchell, SL na St George, K. Tathmini ya kitambulisho cha COVID19 sasa EUA assay.Mitchell SL na St George K. Tathmini ya kitambulisho cha COVID19 sasa EUA assay. J. Kliniki. Virusi. 128, 104429. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. Ugunduzi wa maabara wa ugonjwa wa coronavirus 2019 (COVID-19) katika ugonjwa unaoshukiwa wa binadamu. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (kupatikana 15 Agosti 2020) (WHO, 2020).
Udugama, B. et al. Utambuzi wa COVID-19: Magonjwa na zana za upimaji. ACS Nano 14 (4), 3822-3835 (2020).
Syed S. et al. Uanzishwaji wa Chuo cha Wanasaikolojia wa Mashariki, Kati na Afrika Kusini - Shule ya Mkoa ya Patholojia ya Mashariki ya Kati na Afrika Kusini. Afrika. J. Lab. dawa. 9 (1), 1-8 (2020).
Taasisi ya Ethiopia ya Afya ya Umma, Wizara ya Afya ya Shirikisho. Mkakati wa kitaifa wa kitaifa na mwongozo wa utambuzi wa maabara ya COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/ephi_pheoc_covid-19_laboratory_diagnosis_eng.pdf (kupatikana 12 Agosti 2020) (Ephi, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, kama vipimo hasi vya uwongo kwa changamoto za maambukizi ya SARS-CoV-2 na athari. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, kama vipimo hasi vya uwongo kwa changamoto za maambukizi ya SARS-CoV-2 na athari.Voloshin S., Patel N. na Kesselheim kama vipimo vya uwongo-hasi kwa maambukizo ya SARS-CoV-2 na matokeo yao.Voloshin S., Patel N. na Kesselheim kama vipimo vya uwongo-hasi kwa uchochezi na athari za maambukizi ya SARS-CoV-2. N. Eng. J. Dawa. 383 (6), E38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki-chanya-chanya na kesi za uwongo-hasi-19: Mikakati ya kuzuia kupumua na usimamizi, chanjo, na mitazamo zaidi. Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki-chanya-chanya na kesi za uwongo-hasi-19: Mikakati ya kuzuia kupumua na usimamizi, chanjo, na mitazamo zaidi. Mouliou, DS & Gourgoulianis, ki ложноположительные и ложнотрицательные случаи Covid-19: " Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki uwongo chanya na kesi hasi za uwongo za COVID-19: Mikakati ya kuzuia kupumua na matibabu, chanjo na njia ya mbele.Muliu, DS na Gurgulianis, Ki-chanya-chanya na kesi hasi za COVID-19: Mikakati ya kuzuia kupumua na matibabu, chanjo na njia ya mbele. Mtaalam Reverend Resquire. dawa. 15 (8), 993-11002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 utambuzi katika idara ya dharura: Kuona mti lakini kupoteza msitu. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 utambuzi katika idara ya dharura: Kuona mti lakini kupoteza msitu.Mouliou, DS, Ioannis, P. na Konstantinos, G. Covid-19 katika idara ya dharura: Tazama mti, upoteze msitu.Muliou DS, Ioannis P., na Konstantinos G. Covid-19 utambuzi katika vyumba vya dharura: sio msitu wa kutosha kwa miti. Kuonekana. dawa. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, E. et al. Uthibitisho na uthibitisho wa utendaji wa uchambuzi na kliniki wa assay ya Abbott Realtime SARS-CoV-2. J. Kliniki. Virusi. 129, 104474. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Yeystanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Kulinganisha seti tano za primer kutoka mkoa tofauti wa genome wa COVID-19 kwa kugundua maambukizi ya virusi na RT-PCR ya kawaida. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Yeystanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonia, B. Ulinganisho wa seti tano za primer kutoka mikoa tofauti ya genome ya COVID-19 kwa kugundua maambukizi ya virusi na RT-PCR ya kawaida.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Yenstanaki, D., Fazlalipour, M. na Aflatunyan, B. Ulinganisho wa seti tano za primers kutoka mikoa tofauti ya genome ya Covid-19 kwa kugundua maambukizi ya virusi na RT-PCR ya kawaida. Mollaei, Hr, Afshar, Aa, Kalantar-Yeystanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonia, B. 比较来自 Covid-19 不同基因组区域的五个引物组 ， 用于通过常规 rt-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Yeystanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonia, B. Ulinganisho wa mikoa 5 ya maumbile ya Covid-19 kwa kugundua maambukizo ya virusi na RT-PCR ya kawaida.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-yenestanaki D, Fazlalipour M. na Aflatunyan B. Ulinganisho wa seti tano za primers kutoka mikoa tofauti ya genome ya Covid-19 kwa kugundua maambukizi ya virusi na RT-PCR ya kawaida.Iran. J. Microbiology. 12 (3), 185 (2020).
Goertzer, I. et al. Matokeo ya awali ya mpango wa kitaifa wa tathmini ya ubora wa nje kwa kugundua mlolongo wa genome ya SARS-CoV-2. J. Kliniki. Virusi. 129, 104537. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Tathmini ya uchambuzi wa ufanisi wa vifaa vitano vya RT-PCR kwa ugonjwa kali wa kupumua wa papo hapo coronavirus 2. J. Kliniki. maabara. Anus. 35 (1), E23643 (2021).
Wang B. et al. Tathmini ya vifaa saba vya kugundua vya SARS-CoV-2 RNA vinavyopatikana nchini China kulingana na athari halisi ya mnyororo wa polymerase (PCR). kliniki. Kemikali. maabara. dawa. 58 (9), E149 -E153 (2020).
Van Casteren, PB et al. Ulinganisho wa vifaa saba vya uchunguzi wa RT-PCR COVID-19. J. Kliniki. Virusi. 128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et al. Ulinganisho wa utendaji wa utambuzi wa vifaa viwili vya PCR kwa kugundua asidi ya kiini cha SARS-CoV-2. J. Kliniki. maabara. Anus. 34 (10), E23554 (2020).
LeFart, PR, nk Utafiti wa kulinganisha wa majukwaa manne ya SARS-CoV-2 ya upimaji wa asidi ya asidi (NAAT) ilionyesha kuwa utendaji wa ID sasa uliharibiwa sana kulingana na aina ya mgonjwa na sampuli. utambuzi. Microbiology. Kuambukiza. dis. 99 (1), 115200 (2021).
Abbott molekuli. Abbott Real-Time SARS-CoV-2 Uchambuzi wa Uchambuzi. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/realtime-sars-cov-2-assay. 1-12. (Kama Agosti 10, 2020) (2020).
Klein, S. et al. Kutengwa kwa SARS-CoV-2 RNA kwa kutumia shanga za sumaku kwa ugunduzi mkubwa wa haraka na RT-qPCR na RT-Lamp. Virusi 12 (8), 863 (2020).
Wakati wa chapisho: Desemba-08-2022
Mipangilio ya faragha